ACS Chem. Biol. │ 通过调控酪蛋白激酶2α中的O‑GlcNAc修饰改变磷酸化蛋白质组

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英文原题:Writing and Erasing O‑GlcNAc on Casein Kinase 2 Alpha Alters the Phosphoproteome

通讯作者:Christina M. Woo 哈佛大学

供稿人:黄宗煜 北京大学



    介绍一篇ACS Chemical Biology的文章,标题为“Writing and Erasing O‑GlcNAc on Casein Kinase 2 Alpha Alters the Phosphoproteome”。文章的通讯作者是来哈佛大学化学与化学生物学系的Christina M. Woo教授。


O连接的N乙酰化葡萄糖胺(O-GlcNAc)是一种在丝氨酸和苏氨酸残基中发现的单糖基化修饰。这种修饰几乎分布在细胞内的所有区域,包括细胞核、细胞质基质以及线粒体等。该修饰在蛋白质中的引入和去除分别依赖于O-GlcNAc转移酶(O-GlcNAc transferase,OGT)和O-GlcNAc水解酶(O-GlcNAcase,OGA)。目前,O-GlcNAc修饰和磷酸化翻译后修饰之间的关系受到了研究者的广泛关注,其中,O-GlcNAc修饰能够与磷酸化翻译后修饰共同调节细胞信号通路,此外,一些激酶中的O-GlcNAc修饰能够通过影响激酶的功能调控某些蛋白质中的磷酸化修饰。


此前的研究表明,酪蛋白激酶2α(Casein Kinase 2 Alpha,CK2α)是酪蛋白激酶2(Casein Kinase 2)中的催化亚基,能够通过位于其中的O-GlcNAc修饰执行相应的功能,但是人们目前还不清楚CK2α中的O-GlcNAc修饰对磷酸化蛋白质组的影响。本文的作者在先前的工作中将靶向识别某些蛋白质的纳米抗体与OGT(nanobody-OGT)或OGA(nanobody-splitOGA)结合,并选择性地在这些蛋白质中引入或去除O-GlcNAc修饰,进而调控其功能。在本文中,作者利用这一策略在CK2α中引入或去除O-GlcNAc修饰,并研究位于CK2α中的O-GlcNAc修饰对磷酸化蛋白质组的影响。


首先,作者同时在HEK293T细胞中过表达CK2α以及nanobody-OGT或nanobody-splitOGA(如图1所示)。随后,他们通过特异性富集EPEA标签捕获在细胞中过表达的CK2α,并利用Western blot检测位于其中的O-GlcNAc修饰。结果表明,只有当nanobody-OGT或nanobody-splitOGA能够靶向识别CK2α时,O-GlcNAc修饰才能够特异地在CK2α中引入或去除。除此之外,与广谱的OGA、OGT抑制剂Thiamet G和OMSI-4b相比, nanobody-OGT和nanobody-splitOGA对O-GlcNAc修饰在CK2α中的引入和去除影响更加显著。这些结果表明,利用nanobody-OGT与nanobody-splitOGA能够选择性地实现O-GlcNAc修饰在CK2α中的引入和去除。

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图1 O-GlcNAc修饰在CK2α中的引入与去除


此前的研究表明,CK2α中的O-GlcNAc修饰主要位于347位的丝氨酸上,但是与其相邻的348位丝氨酸也有一定的可能被O-GlcNAc修饰。随后,作者通过对347位和348位丝氨酸进行定点突变检测CK2α中O-GlcNAc修饰的具体位点(如图2所示)。结果表明,当347位的丝氨酸突变为丙氨酸时,O-GlcNAc修饰不能被nanobody-OGT顺利引入,而348位的突变对结果没有任何影响,因此CK2α中的大多数O-GlcNAc修饰位于347位的丝氨酸。在此前的一些工作中,研究人员将能够被O-GlcNAc修饰的丝氨酸位点突变为半胱氨酸,从而专门研究OGT在这些位点上引入O-GlcNAc修饰的效果,因为一般来说,OGT能够在半胱氨酸上引入O-GlcNAc修饰,而位于半胱氨酸上的O-GlcNAc修饰不能被OGA识别。而在本文中,作者将347位丝氨酸突变为半胱氨酸,并尝试利用nanobody-OGT在该位点引入O-GlcNAc修饰。随后他们通过酶法标记在O-GlcNAc修饰上引入生物素(biotin)标签,利用链霉亲和素(streptavidin)富集含有O-GlcNAc修饰的CK2α,并通过与CK2α相连的FLAG标签对其进行检测。结果表明347位的半胱氨酸不能被nanobody-OGT引入O-GlcNAc修饰。因此,以上这些结果证明了本文所采用的策略在O-GlcNAc修饰研究中的可靠性。

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图2 CK2α中的O-GlcNAc修饰位点位于347位丝氨酸


随后,作者在HEK293T细胞中过表达CK2α,利用nanobody-OGT或nanobody-splitOGA在CK2α中引入或去除O-GlcNAc修饰,并通过质谱检测磷酸化蛋白质组的变化,带有磷酸化修饰的蛋白质可以利用TiO2载体进行富集(如图3所示)。由于CK2α中本底的O-GlcNAc修饰丰度很低,nanobody-splitOGA对O-GlcNAc修饰的影响较小,因此作者最终在利用nanobody-OGT引入O-GlcNAc修饰的实验组中鉴定到了更多磷酸化蛋白质。一些富集程度较高磷酸化蛋白质均和CK2α中的O-GlcNAc修饰有关。

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图3 CK2α中的O-GlcNAc修饰位影响磷酸化蛋白质组


除此之外,大部分和CK2α中的O-GlcNAc修饰有关的磷酸化位点都是在利用nanobody-OGT引入O-GlcNAc修饰的实验组中检测到的,并且这些磷酸化位点的富集程度均相对较高(如图4所示)。因此,以上这些结果再次验证了nanobody-OGT与nanobody-splitOGA在研究O-GlcNAc修饰如何影响磷酸化蛋白质组中的价值。

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图4 CK2α中的O-GlcNAc修饰位影响磷酸化位点


总而言之,本文的作者利用与纳米抗体结合的O-GlcNAc修饰酶与去修饰酶调控特定蛋白质中的O-GlcNAc修饰,并检测目标蛋白质中的O-GlcNAc修饰对磷酸化蛋白质组的影响。他们以一个较为简单的激酶CK2α为模型验证了这一策略的可靠性,日后这一策略很可能被拓展至其他O-GlcNAc修饰的研究中,从而进行更加深入的探索。



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