分享一篇发表在Angew. Chem. Int. Ed.上的文章，题目为“Lysine-targeting, Covalent Inhibitors of Bromodomain BD1 of BET Proteins in Live Cells and Animals”，第一通讯作者是来自山东大学基础医学院的谢玉生教授，研究方向为化学生物学工具的开发与应用，以及通过AI和化学蛋白质组学辅助的药物发现。这篇文章中，作者利用赖氨酸反应性探针对溴结构域中的可靶向赖氨酸进行全局分析，并开发靶向BD1的共价抑制剂。

含溴结构域（BRD）蛋白在各种细胞过程中发挥作用，开发靶向BRD的抑制剂可用于癌症和炎症等疾病的治疗。传统非共价BRD抑制剂存在脱靶效应和无法区分不同BRD等问题，相比之下，共价抑制剂有望提供更好的选择性以提高药物的安全和有效性。考虑到赖氨酸残基在大多数BRD中相当保守，因此作者希望开发靶向赖氨酸的BRD共价抑制剂。

为了系统分析BRD赖氨酸残基的可靶向性，作者首先将多种赖氨酸反应基团引入溴孢菌素（一种泛BRD抑制剂）的结构中，将其作为针对BRD赖氨酸的基于活性的探针。基于凝胶的荧光信号显示带有2-乙炔基苯甲醛（EBA）弹头的探针P7具有最好的蛋白质标记效率。因此作者使用P7进行活细胞和小鼠原位标记的ABPP实验，质谱结果显示探针可以有效富集到多种BRD，说明EBA反应基团可以用于BRD抑制剂的开发。

考虑到对串联的两个溴结构域BD1/2开发单结构域特异性抑制剂可能获得更具针对性的治疗效果，作者进一步希望利用EBA基团改善已有抑制剂的选择性。于是作者在一种具有一定BD1选择性的非共价抑制剂PLX51107上引入了不可逆共价弹头EBA或可逆共价弹头水杨醛（SA），结果显示以特定位置引入EBA基团得到的共价抑制剂BDS4可以显著提高对BD1的选择性。

最后，作者在细胞和动物模型中验证了BDS4具有抗纤维化活性。

总的来说，这篇文章作者利用基于泛BRD抑制剂的赖氨酸ABP对BRD中的可靶向赖氨酸残基进行了分析，然后使用EBA弹头构造了特异性靶向BD1的共价抑制剂。

本文作者：LCX

责任编辑：LZ

DOI：10.1002/anie.202424832

原文链接：https://doi.org/10.1002/anie.202424832